Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtskP55097 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtskP55097 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtskP55097 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtskP55097 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtskP55097 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtskP55097 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtskP55097 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtskP55097 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtskP55097 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtskP55097 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms