Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms