Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc12a1P55014 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms