Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Faf1P54731 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Faf1P54731 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Faf1P54731 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms