Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms