Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HccsP53702 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HccsP53702 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HccsP53702 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HccsP53702 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HccsP53702 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
HccsP53702 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HccsP53702 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HccsP53702 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HccsP53702 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HccsP53702 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HccsP53702 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HccsP53702 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms