Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efnb1P52795 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms