Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efna1P52793 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna1P52793 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna1P52793 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efna1P52793 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms