Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms