Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e1P52482 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2e1P52482 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms