Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LumP51885 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LumP51885 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LumP51885 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LumP51885 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LumP51885 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LumP51885 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LumP51885 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms