Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RoraP51448 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RoraP51448 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RoraP51448 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms