Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms