Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cav1P49817 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms