Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk5P49615 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms