Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb42P49222 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms