Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms