Protein–RNA interactions for Protein: P48381

Rfx3, Transcription factor RFX3, mousemouse

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx3P48381 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx3P48381 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx3P48381 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms