Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Resp18P47939 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Resp18P47939 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms