Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Emp1P47801 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms