Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrprbP47758 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms