Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab11bP46638 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rab11bP46638 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab11bP46638 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab11bP46638 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rab11bP46638 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rab11bP46638 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11bP46638 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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