Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx2P43241 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx2P43241 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms