Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NodalP43021 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NodalP43021 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NodalP43021 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NodalP43021 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NodalP43021 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NodalP43021 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NodalP43021 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NodalP43021 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NodalP43021 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms