Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkx2-5P42582 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx2-5P42582 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms