Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3rP40223 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms