Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col18a1P39061 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Col18a1P39061 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms