Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc5P32043 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc5P32043 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms