Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms