Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tacr1P30548 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms