Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msr1P30204 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms