Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VtnP29788 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VtnP29788 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VtnP29788 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms