Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp1P29452 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp1P29452 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms