Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CtgfP29268 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtgfP29268 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms