Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprmP28828 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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