Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxraP28700 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxraP28700 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxraP28700 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxraP28700 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxraP28700 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxraP28700 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxraP28700 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RxraP28700 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms