Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms