Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apex1P28352 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apex1P28352 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms