Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb3P28231 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb3P28231 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms