Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb1P28230 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb1P28230 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms