Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CftrP26361 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CftrP26361 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CftrP26361 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CftrP26361 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CftrP26361 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CftrP26361 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CftrP26361 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CftrP26361 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CftrP26361 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CftrP26361 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CftrP26361 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CftrP26361 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CftrP26361 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CftrP26361 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CftrP26361 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CftrP26361 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CftrP26361 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CftrP26361 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CftrP26361 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CftrP26361 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms