Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChgaP26339 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChgaP26339 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms