Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UbtfP25976 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UbtfP25976 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms