Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf1bP25119 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf1bP25119 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms