Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja1P23242 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja1P23242 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja1P23242 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms