Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PparaP23204 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PparaP23204 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PparaP23204 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PparaP23204 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PparaP23204 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PparaP23204 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PparaP23204 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PparaP23204 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PparaP23204 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PparaP23204 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PparaP23204 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms