Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx3P23198 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms