Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Myo5bP21271 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myo5bP21271 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms