Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcer1aP20489 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms