Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TP20293 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TP20293 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TP20293 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TP20293 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TP20293 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TP20293 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TP20293 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TP20293 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TP20293 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TP20293 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TP20293 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TP20293 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms